El Irati entra en Aezkoa y se reposa en Irabia, un remanso de agua en el corazón de la Selva. Tras dejar el bosque, fluye por Orbaizeta, para pasar por Orbara hacia Aribe, donde ofrece estampas de gran belleza. Las aguas del Irati van por el valle del mismo nombre y una vez abandonada Aezkoa continúan su curso hasta llegar a las impresionantes gargantas de la Foz de Lumbier. Finalmente, tras 88 km, su recorrido termina en el Aragón.
Principales afluentes en Aezkoa: Egurgio, Erlan, Irau, Legartza, Aranola, Oiaran, Aztapar, Zepetea, Kakolla, Berrendipea y Zorrate.